مهدی باکری در مدت کوتاهی مدارج ترقی را در جبهه طی کرد.
در عملیات فتح المبین با عنوان معاون تیپ نجف اشرف توانست
در کسب پیروزی موثر باشد. در همان عملیات از ناحیه چشم
مجروح شد. پس از بهبود به جبهه بازگشت و در عملیاتهایی
چون عملیات بیتالمقدس، رمضان، مسلم بن عقیل، والفجر مقدماتی،
والفجر 1 تا چهار و عملیات خیبر در سمتهای مختلف شرکت کرد.
در مجموعه عملیاتهای والفجر با عنوان فرمانده لشکر عاشورا در جبهه
حضور داشت.
در عملیات خیبر زمانی که خبر کشته شدن برادرش را به وی دادند،
بدون ابراز اندوه با خانوادهاش تماس گرفت و چنین گفت:
شهادت حمید یکی از الطاف الهی است که شامل حال خانواده ما شدهاست.
در حین عملیات بدر و در حالیکه نیروهای بعثی با محاصره کامل سربازان
تحت امر باکری در جزیره مجنون در حال زدن تیر خلاص به سربازان مجروح
بودند، احمد کاظمیو محمود دولتی با اصرار از وی میخواهند که با عبور
از دجله و پیمودن فاصله700 متری که میان خط اول و خط دوم حمله جان
خود را نجات دهد؛ ولی این درخواست هر بار با جواب منفی وی روبرو میشد
تا اینکه بر اثر اصابت تیر مستقیم سربازان عراقی در تاریخ 25 اسفند 1363 به
شهادت رسید.در این هنگام در حالی که یاران او سعی در انتقال پیکرش
بوسیله قایق به عقب را داشتند قایق هدف اصابت شلیک مستقیم آر پی جی
یکی از سربازان بعثی قرار گرفته، در اروند رود غرق میشود. پیکر وی و سایر
سربازانش هیچگاه یافت نشد و وی همچنان جاویدالاثر میباشد.